Bakteriyal enfeksiyonlar antibiyotiklerle tedavi edilebilir ancak viral enfeksiyonları antibiyorik etkilemez. Viral enfeksiyonlar daha çok bulaşıcıdırlar. Streptokok bakteriyal enfeksiyonlarında ise en önemli tehlike kalp kapaklarının tutulmasıdır (romatizmal ateş). Sık bademcik iltihabı geçiren çokcuklarda boyunda şişlik ve boğaz ağrısı birlikte olabilir.

Özellikle sabahları oluşan boğaz ağrısının diğer bir sebebi mide içeriğinin yemek borusuna kaçarak (reflü) asitli muhtevanın yakmasıdır. Bunu önlemek için yatmadan birkaç saat öncesine kadar birşeyler yenmemelidir. Ayrıca bir oturuşta çok fazla yemek te buna neden olabilir.

Uzun süreli sigara ve alkol alanlarda, boğaz ağrısı ve boyunda şişlik kanser belirtisi olabilir. Yine kışın yatak odası havasının kuruması, neminin azalması da boğaz ağrısına neden olabilir. Bunun için soğuk buhar cihazları kullanılabilir.

Boyunda şişlik kitle sebepleri arasında en sık lenf büyümesi (lenfadenopati) gelir. Lenf büyümesi çoğu zaman iltihabi bir duruma bağlı olabilir. Ancak bazen de boyun bölgesinde ya da bu bölgeye drene olan yüz dudak gibi bölgelerdeki kanser kitlesinden boyun lenf bezlerine yayılma sonucu boyunda şişlik oluşabilir. Böyle bir durumda boyundaki kitlenin çok iyi araştırılması gerekir.

Özellikle 1 santimden büyük sert ve etrafa yapışık durumda olan lenf bezleri daha büyük önem taşır. Genellikle 2 haftadan kısa süren lenf büyümeleri iltihabi kaynaklı olabilir. Bazı virus enfeksiyonlarında, HIV, verem gibi hastalıklarda ise 2 haftadan daha uzun sürebilir. Bunlar dışında mesleki hastalıklar tarımla uğraşanlarda, evde hayvan besleyenlerde, boyunda lenf büyümesi olabilir.